Ana Cámara Artigas
Investigación
Determinación estructural de proteínas
En nuestro grupo de investigación nos hemos especializado en la cristalización de proteínas y la determinación de sus estructuras mediante la técnica de difracción de Rayos X.
Nuestra investigación actualmente se centra en el estudio estructural de varios dominios modulares, entre los que se encuentran los dominios SH3, WW, PDZ o UEV.
Estamos interesados en el estudio de las interacciones entre dominios modulares de reconocimiento de secuencias ricas en prolina (MRP) y sus ligandos. Estas son esenciales para el correcto funcionamiento celular, por lo que estos dominios son atractivas dianas para el diseño de inhibidores específicos de sus interacciones con potencial terapéutico. El diseño eficaz de ligandos requiere la racionalización del proceso basada en la disección y comprensión de la naturaleza de las interacciones y de sus efectos sobre la cooperatividad y dinámica estructural. El objetivo fundamental de nuestro equipo de investigación es adquirir una profunda y detallada comprensión de las reglas que determinan la afinidad y especificidad de unión en las distintas familias de MRP como fundamento para el desarrollo de estrategias eficientes para el diseño racional de ligandos de estos dominios y la identificación de dianas de relevancia fisiológica en el contexto de un determinado genoma. Para ello nuestro objetivo es abordar la caracterización de los distintos MRP y sus complejos haciendo uso de una metodología multidisciplinar que conjuga técnicas experimentales y computacionales y que nos permitirá abordar el proceso de diseño incorporando consideraciones termodinámicas, estructurales, funcionales y dinámicas.
Algunos dominios modulares presentan además la ventaja de poder ser utilizados como modelos para estudios de plegamiento. Otro de los intereses de nuestro laboratorio es el estudio de la formación de estructuras entrecruzadas. Los dominios SH3 pueden formar este tipo de estructuras y, en algunos casos, tambien fibras amiloides. Nuestro laboratorio esta realizando una serie de estudios para poder enterder el mecanismo de formación de dominios entrecruzados y su posible vinculación al desarrollo de fibras amiloides.
Estructuras depositadas en el Protein Data Bank